Rapid chromosomal evolution in the mesic four‐striped grass ratRhabdomys dilectus(Rodentia, Muridae) revealed by mtDNA phylogeographic analysis

• DOI: 10.1111/j.1439-0469.2011.00627.x
• Publication Date: 2011-08-18T04:36:17Z
• Authors: Riccardo Castiglia; Emanuela Solano; Rhodes H. Makundi; Jan Hulselmans; Erik Verheyen; Paolo Colangelo
• Keywords: Paraphyly; Monophyly; Maximum parsimony; Molecular Phylogenetics

The mesic four-striped grass rat Rhabdomys dilectus De Winton, 1897 is distributed in regions of southern and eastern Africa. We carried out a molecular chromosomal study the northernmost populations species to provide insight into subspecific boundaries identified within describe its genetic structure Eastern Maximum likelihood, maximum parsimony neighbour-joining methods were used construct phylogenetic relationships among all haplotypes belonging large part range. Times divergences estimated assuming relaxed clock with two calibration points. three well-supported clades R. dilectus. One basal clade corresponding d. chakae (2n = 48) found South Two additional sister 48 2n 46) are allopatrically northern parts Genetic divergence relatively high (ranges 4.2–5.7%). A very divergent new karyotype 38, FNa 60 was high-altitude on Mt. Meru Kilimanjaro. differences consist Robertsonian fusions one whole-arm reciprocal translocation. Interestingly, mtDNA phylogeny does not match diploid numbers. In fact, 38 specimens form monophyletic group that includes 46 appears as paraphyletic. originated peripatric condition during last phases Pleistocene. This confirms importance analysis detecting taxonomic units cryptic diversity rodents. è un muride distribuito nelle savane dell'Africa meridionale ed orientale. questo lavoro stato effettuato uno studio molecolare (sequenze del gene mitocondriale per il citocromo b) e cromosomico delle popolazioni presenti nella parte più settentrionale areale della specie. Sono stati usati diversi metodi (massima verosimiglianza, massima parsimonia 'neighbor-joining') ricostruire i rapporti filogenetici tra gli aplotipi mitocondriali. I tempi di divergenza sono stimati assumendo orologio 'relaxed' con due punti calibrazione. identificati tre cladi ben supportati statisticamente all'interno Un basale, corrispondente 48), si trova Africa mentre ulteriori cladi, corrispondenti distribuiti allopatricamente restante dell'areale. La genetica 3 relativamente alta (compresa 4.2 5.7%). cariotipo molto divergente 60) identificato ad elevate altitudini sul Monte Tuttavia, la filogenesi basata b non corrisponde interamente ai numeri diploidi riscontrati. Infatti, individui formano gruppo monofiletico che include animali quindi risulta parafiletico. Si può stimare nuovo sia originato una condizione peripatrica durante l'ultima fase Questo conferma l'importanza analisi cromosomiche individuazione unità tassonomiche nello diversità nei roditori. Appendix S1. localities this study. Please note: publisher responsible for content or functionality any supporting information supplied by authors. Any queries (other than missing content) should be directed author article.