Avian influenza A (H5N1) outbreaks in different poultry farm types in Egypt: the effect of vaccination, closing status and farm size

• DOI: 10.1186/s12917-018-1519-8
• Publication Date: 2018-06-18T12:04:32Z
• Authors: Jean Artois; Carla Ippoliti; Annamaria Conte; Madhur S. Dhingra; Pastor Alfonso; Abdelgawad El Tahawy; Ahmed Elbestawy; Hany F. Ellakany; Marius Gilbert
• Keywords: Poultry farms; Epidemiology; Veterinary medicine; Influenza A virus subtype H5N1; Risk or protective factors; Avian influenza A (H5N1); FOS: Health sciences; Disease Outbreaks; Agricultural and Biological Sciences; 0403 veterinary science; Sociology; SF600-1100; 2. Zero hunger; Geography; Ecology; H1N1; Vaccination; Poultry farming; Life Sciences; Agriculture; 04 agricultural and veterinary sciences; Sciences bio-médicales et agricoles; Highly pathogenic; Virus; FOS: Sociology; 3. Good health; Ducks; Treatment Outcome; Infectious Diseases; Environmental health; Influenza Vaccines; Biosecurity; Medicine; Egypt; Research Article; Livestock; Dynamics of Livestock Disease Transmission and Control; Virology; Health Sciences; Animals; Biology; Poultry Diseases; Influenza A Virus, H5N1 Subtype; Gastrointestinal Viral Infections and Vaccines Development; Outbreak; Socioeconomics; Influenza in Birds; FOS: Biological sciences; Influenza Virus Research and Epidemiology; Chickens; Agronomy and Crop Science

Le virus de la grippe aviaire A (H5N1) est endémique chez la volaille en Égypte. L'hiver 2014/2015 a été particulièrement inquiétant avec l'émergence de nouveaux groupes de virus IAHP A (H5N1), entraînant un nombre important de foyers d'IA A (H5N1) dans les élevages de volailles et des cas humains sporadiques. À ce jour, peu d'études ont étudié la répartition des foyers d'IAHP A (H5N1) en Égypte par rapport aux facteurs de protection / risque au niveau de la ferme, une lacune que nous avons l'intention de combler. L'objectif de l'étude était d'analyser les données de surveillance passive basées sur l'observation d'une mortalité soudaine et élevée de la volaille ou d'une baisse de la production de canards ou d'œufs de poule, afin de mieux comprendre et de discuter du risque de présence de l'IAHP A (H5N1) au niveau des exploitations dans de grandes parties du delta du Nil. La probabilité de présence de l'IAHP A (H5N1) était associée à plusieurs caractéristiques des exploitations. L'état de vaccination, l'absence de fenêtres/ouvertures dans la ferme et le nombre d'oiseaux par cycle de production se sont avérés être des facteurs de protection, tandis que la présence d'une ferme canard avec une mortalité importante ou une baisse de la production d'œufs dans le village s'est avérée être un facteur de risque. Les résultats démontrent le rôle clé de plusieurs mesures de prévention et de biosécurité pour réduire la circulation du virus IAHP A (H5N1), ce qui pourrait promouvoir une meilleure biosécurité des élevages de volailles en Égypte.<br/>The Avian Influenza A (H5N1) virus is endemic in poultry in Egypt. The winter of 2014/2015 was particularly worrying as new clusters of HPAI A (H5N1) virus emerged, leading to an important number of AI A (H5N1) outbreaks in poultry farms and sporadic human cases. To date, few studies have investigated the distribution of HPAI A (H5N1) outbreaks in Egypt in relation to protective / risk factors at the farm level, a gap we intend to fill. The aim of the study was to analyse passive surveillance data that were based on observation of sudden and high mortality of poultry or drop in duck or chicken egg production, as a basis to better understand and discuss the risk of HPAI A (H5N1) presence at the farm level in large parts of the Nile Delta.The probability of HPAI A (H5N1) presence was associated with several characteristics of the farms. Vaccination status, absence of windows/openings in the farm and the number of birds per cycle of production were found to be protective factors, whereas the presence of a duck farm with significant mortality or drop in egg production in the village was found to be a risk factor.Results demonstrate the key role of several prevention and biosecurity measures to reduce HPAI A (H5N1) virus circulation, which could promote better poultry farm biosecurity in Egypt.<br/>El virus de la gripe aviar A (H5N1) es endémico en las aves de corral de Egipto. El invierno de 2014/2015 fue particularmente preocupante a medida que surgieron nuevos grupos de virus HPAI A (H5N1), lo que provocó un número importante de brotes de AI A (H5N1) en granjas avícolas y casos humanos esporádicos. Hasta la fecha, pocos estudios han investigado la distribución de los brotes de IAAP A (H5N1) en Egipto en relación con los factores de protección / riesgo a nivel de granja, un vacío que pretendemos llenar. El objetivo del estudio fue analizar los datos de vigilancia pasiva que se basaron en observar la mortalidad repentina y alta de aves de corral o la caída en la producción de huevos de pato o gallina, como base para comprender mejor y discutir el riesgo de presencia de HPAI A (H5N1) a nivel de granja en gran parte del Delta del Nilo. La probabilidad de presencia de HPAI A (H5N1) se asoció con varias características de las granjas. Se encontró que el estado de vacunación, la ausencia de ventanas/aberturas en la granja y el número de aves por ciclo de producción eran factores protectores, mientras que la presencia de una granja de patos con una mortalidad significativa o una caída en la producción de huevos en la aldea era un factor de riesgo. Los resultados demuestran el papel clave de varias medidas de prevención y bioseguridad para reducir la circulación del virus HPAI A (H5N1), lo que podría promover una mejor bioseguridad de las granjas avícolas en Egipto.<br/>فيروس أنفلونزا الطيور A (H5N1) مستوطن في الدواجن في مصر. كان شتاء 2014/2015 مقلقًا بشكل خاص مع ظهور مجموعات جديدة من فيروس HPAI A (H5N1)، مما أدى إلى عدد كبير من تفشي AI A (H5N1) في مزارع الدواجن وحالات بشرية متفرقة. حتى الآن، حققت دراسات قليلة في توزيع تفشي HPAI A (H5N1) في مصر فيما يتعلق بعوامل الحماية / الخطر على مستوى المزرعة، وهي فجوة نعتزم سدها. كان الهدف من الدراسة هو تحليل بيانات المراقبة السلبية التي استندت إلى ملاحظة الوفيات المفاجئة والمرتفعة للدواجن أو انخفاض إنتاج بيض البط أو الدجاج، كأساس لفهم ومناقشة مخاطر وجود HPAI A (H5N1) بشكل أفضل على مستوى المزرعة في أجزاء كبيرة من دلتا النيل. ارتبط احتمال وجود HPAI A (H5N1) بالعديد من خصائص المزارع. وُجد أن حالة التطعيم وغياب النوافذ/الفتحات في المزرعة وعدد الطيور لكل دورة إنتاج هي عوامل وقائية، في حين وُجد أن وجود مزرعة بطة ذات معدل وفيات كبير أو انخفاض في إنتاج البيض في القرية هو عامل خطر. أظهرت النتائج الدور الرئيسي للعديد من تدابير الوقاية والأمن البيولوجي للحد من انتشار فيروس HPAI A (H5N1)، والتي يمكن أن تعزز الأمن البيولوجي لمزرعة الدواجن في مصر.<br/>