The mitochondrial ancestor of bonobos and the origin of their major haplogroups

• DOI: 10.1371/journal.pone.0174851
• Publication Date: 2017-05-03T13:27:15Z
• Authors: Hiroyuki Takemoto; Yoshi Kawamoto; Shoko Higuchi; Emiko Makinose; John A. Hart; Térese B. Hart; Tetsuya Sakamaki; Nahoko Tokuyama; Gay E. Reinartz; Patrick Guislain; Jef Dupain; Amy K. Cobden; Mbangi N. Mulavwa; Kumugo Yangozene; Serge Darroze; Céline Devos; Takeshi Furuichi
• Keywords: Bonobo; Wildlife Ecology and Conservation Biology; Phanerozoic; Social Sciences; Evolutionary biology; Gene; Haplogroup; Sociology; Haplotype; Psychology; Phylogeny; 0303 health sciences; Ecology; Geography; Eutheria; Cenozoic; Q; R; Pan paniscus; Mitochondrial DNA; Structural basin; FOS: Sociology; FOS: Psychology; Earth and Planetary Sciences; Archaeology; Physical Sciences; Medicine; Research Article; Social Psychology; Genotype; Science; Population; Most recent common ancestor; DNA, Mitochondrial; Evolution, Molecular; 03 medical and health sciences; Biological dispersal; Genetics; Animals; Biology; Demography; Evolution of Social Behavior in Primates; Paleontology; Evolutionary Dynamics of Mammals and Their Ancestors; 15. Life on land; Haplotypes; Habitat Selection; FOS: Biological sciences; Environmental Science; Ancestor; Zoology; Phylogenetic tree

Aquí informamos dónde se ubicó el ancestro común más reciente (MRCA) de los bonobos (Pan paniscus) y cómo se dispersaron por su hábitat actual. La datación molecular del ADN mitocondrial (ADNmt) para analizar el tiempo hasta MRCA (TMRCA) y los principales haplogrupos de ADNmt de bonobos silvestres se realizó utilizando nuevas estimaciones del tiempo de divergencia de los bonobos de otras especies de Pan para investigar las rutas de dispersión de los bonobos sobre el área forestal de la orilla izquierda del río Congo. El TMRCA de los bonobos se estimó en 0,64 o 0,95 millones de años (Ma). Seis haplogrupos principales tenían orígenes muy antiguos de 0,38 Ma o más. La reconstrucción del área ancestral reveló que el ancestro mitocondrial de las poblaciones de bonobo se extendía en el área oriental del hábitat actual de los bonobos. Los haplogrupos pueden haberse formado a partir de los bosques ribereños a lo largo del río Congo o del centro de la cuenca sur del Congo. La fragmentación de los refugios forestales durante los períodos más fríos puede haber afectado en gran medida la formación de la estructura genética de las poblaciones de bonobo.<br/>We report here where the most recent common ancestor (MRCA) of bonobos (Pan paniscus) ranged and how they dispersed throughout their current habitat. Mitochondrial DNA (mtDNA) molecular dating to analyze the time to MRCA (TMRCA) and the major mtDNA haplogroups of wild bonobos were performed using new estimations of divergence time of bonobos from other Pan species to investigate the dispersal routes of bonobos over the forest area of the Congo River's left bank. The TMRCA of bonobos was estimated to be 0.64 or 0.95 million years ago (Ma). Six major haplogroups had very old origins of 0.38 Ma or older. The reconstruction of the ancestral area revealed the mitochondrial ancestor of the bonobo populations ranged in the eastern area of the current bonobos' habitat. The haplogroups may have been formed from either the riparian forests along the Congo River or the center of the southern Congo Basin. Fragmentation of the forest refugia during the cooler periods may have greatly affected the formation of the genetic structure of bonobo populations.<br/>نبلغ هنا عن أحدث سلف مشترك (MRCA) للبابون (Pan paniscus) وكيف انتشر في جميع أنحاء موطنه الحالي. تم إجراء التأريخ الجزيئي للحمض النووي الميتوكوندري (mtDNA) لتحليل الوقت إلى MRCA (TMRCA) والمجموعات الهابلوغرافية الرئيسية للحمض النووي الميتوكوندري من البابون البري باستخدام تقديرات جديدة لوقت الاختلاف بين البابون من أنواع البان الأخرى للتحقيق في طرق تشتت البابون على منطقة الغابات في الضفة اليسرى لنهر الكونغو. تم تقدير TMRCA من البونوبو قبل 0.64 أو 0.95 مليون سنة (Ma). كان لدى ست مجموعات هابلوغرافية رئيسية أصول قديمة جدًا تبلغ 0.38 مليون سنة أو أكثر. كشفت إعادة بناء منطقة الأجداد عن سلف الميتوكوندريا لسكان البونوبو الذين تراوحوا في المنطقة الشرقية من موطن البونوبو الحالي. ربما تكون المجموعات الفردانية قد تشكلت إما من الغابات النهرية على طول نهر الكونغو أو وسط حوض الكونغو الجنوبي. قد يكون تفتيت ملجأ الغابات خلال فترات البرودة قد أثر بشكل كبير على تكوين البنية الوراثية لسكان البونوبو.<br/>Nous rapportons ici où se trouvait l'ancêtre commun le plus récent (MRCA) des bonobos (Pan paniscus) et comment ils se sont dispersés dans leur habitat actuel. La datation moléculaire de l'ADN mitochondrial (ADNmt) pour analyser le temps jusqu'au MRCA (TMRCA) et les principaux haplogroupes d'ADNmt des bonobos sauvages a été réalisée en utilisant de nouvelles estimations du temps de divergence des bonobos d'autres espèces de Pan pour étudier les voies de dispersion des bonobos sur la zone forestière de la rive gauche du fleuve Congo. Le TMRCA des bonobos a été estimé à 0,64 ou 0,95 million d'années (Ma). Six haplogroupes majeurs avaient des origines très anciennes de 0,38 Ma ou plus. La reconstruction de la zone ancestrale a révélé que l'ancêtre mitochondrial des populations de bonobos se trouvait dans la zone orientale de l'habitat actuel des bonobos. Les haplogroupes peuvent avoir été formés à partir des forêts riveraines le long du fleuve Congo ou du centre du bassin méridional du Congo. La fragmentation des refuges forestiers pendant les périodes plus fraîches peut avoir grandement affecté la formation de la structure génétique des populations de bonobos.<br/>