Evidence for Novel Hepaciviruses in Rodents
Hepacivirus
FOS: Health sciences
Gene
Agricultural and Biological Sciences
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_714
flavivirus
Chiroptera
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5083
Biology (General)
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_8355
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1560
Hepaciviruses
Rodent
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_166
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_7260
mammifère
Life Sciences
Virus
3. Good health
Tissue tropism
[SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1434
Medicine
L72 - Organismes nuisibles des animaux
570
Hepatitis C Virus
QH301-705.5
Molecular Sequence Data
Immunology
Rodentia
Tropism
Microbiology
EMC MM-04-27-01
Evolution, Molecular
03 medical and health sciences
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6633
SDG 3 - Good Health and Well-being
Health Sciences
phylogénie
Genetics
Horses
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37854
Biology
Molecular Biology
Perissodactyla
Antibody
pestivirus
rongeur
génome
Gastrointestinal Viral Infections and Vaccines Development
Hepatitis C Antibodies
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4560
Viruses -- Evolution
génie génétique
FOS: Biological sciences
Cats
identification
Animal Science and Zoology
Parasitology
Immunologic diseases. Allergy
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1331
Phylogenetic tree
0301 basic medicine
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_11527
Carnivora
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_13948
Seroprevalence
Hepatitis, Animal
L73 - Maladies des animaux
[SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
Genome
Ecology
Hepatitis C virus
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2724
Hepatitis C
Infectious Diseases
Serology
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5711
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2963
RNA, Viral
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15974
Research Article
hépatite
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_28665
Genome, Viral
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5740
Dogs
Virology
Animals
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_13325
Viral Diseases in Livestock and Poultry
Base Sequence
Hepatology
Flaviviridae
L60 - Taxonomie et géographie animales
RC581-607
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3791
Enquête pathologique
[SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Hepatitis C Infection and Treatment
[SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Rodents as laboratory animals
Zoology
distribution géographique
DOI:
10.1371/journal.ppat.1003438
Publication Date:
2013-07-16T19:48:00Z
AUTHORS (37)
ABSTRACT
El virus de la hepatitis C (VHC) se encuentra entre las causas más relevantes de cirrosis hepática y carcinoma hepatocelular. La investigación se complica por la falta de modelos de animales pequeños accesibles. La investigación sistemática de virus de pequeños mamíferos podría guiar los esfuerzos para establecer tales modelos, al tiempo que proporciona información sobre la biología evolutiva viral. Hemos reunido la colección más grande hasta ahora de muestras de pequeños mamíferos de todo el mundo, calificadas para ser examinadas en busca de virus transmitidos por la sangre, incluidos sueros y órganos de 4.770 roedores (41 especies); y sueros de 2.939 murciélagos (51 especies). Se detectaron tres clados de hepacivirus de roedores altamente divergentes en 27 (1,8%) de 1.465 ratones de banco europeos (Myodes glareolus) y 10 (1,9%) de 518 ratones sudafricanos de cuatro rayas (Rhabdomys pumilio). Los murciélagos mostraron reactividades de inmunotransferencia anti-VHC pero no detección de virus, aunque la relación genética sugerida por los resultados serológicos debería haber permitido la detección de ARN utilizando los ensayos de PCR ampliamente reactivos desarrollados para este estudio. Se probaron 210 caballos y 858 gatos y perros, produciendo más hepacivirus asociados a caballos pero ninguno en perros o gatos. Los virus de roedores eran equidistantes al VHC, superando con creces la diversidad del VHC y los hepacivirus caninos/equinos tomados en conjunto. Se secuenciaron cinco genomas completos, que representan todos los linajes virales. Las características genómicas destacadas y los criterios de distancia respaldaron la clasificación de todos los virus como hepacivirus. La RT-PCR cuantitativa, la hibridación in situ de ARN y la histopatología sugirieron tropismo hepático con inflamación hepática similar a la hepatitis C. La serología recombinante para dos linajes distintos de hepacivirus en 97 ratones de banco identificó tasas de seroprevalencia de 8.3 y 12.4%, respectivamente. Los anticuerpos en los sueros de los topillos de banco no reaccionaron de forma cruzada con el VHC ni con el hepacivirus heterólogo de los topillos de banco. Se encontró co-ocurrencia de ARN y anticuerpos en 3 de 57 sueros de topillos bancarios positivos para PCR (5.3%). Nuestros datos permiten nuevas hipótesis sobre la evolución del VHC y fomentan los esfuerzos para desarrollar modelos sustitutos de roedores para el VHC.<br/>Hepatitis C virus (HCV) is among the most relevant causes of liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Research is complicated by a lack of accessible small animal models. The systematic investigation of viruses of small mammals could guide efforts to establish such models, while providing insight into viral evolutionary biology. We have assembled the so-far largest collection of small-mammal samples from around the world, qualified to be screened for bloodborne viruses, including sera and organs from 4,770 rodents (41 species); and sera from 2,939 bats (51 species). Three highly divergent rodent hepacivirus clades were detected in 27 (1.8%) of 1,465 European bank voles (Myodes glareolus) and 10 (1.9%) of 518 South African four-striped mice (Rhabdomys pumilio). Bats showed anti-HCV immunoblot reactivities but no virus detection, although the genetic relatedness suggested by the serologic results should have enabled RNA detection using the broadly reactive PCR assays developed for this study. 210 horses and 858 cats and dogs were tested, yielding further horse-associated hepaciviruses but none in dogs or cats. The rodent viruses were equidistant to HCV, exceeding by far the diversity of HCV and the canine/equine hepaciviruses taken together. Five full genomes were sequenced, representing all viral lineages. Salient genome features and distance criteria supported classification of all viruses as hepaciviruses. Quantitative RT-PCR, RNA in-situ hybridisation, and histopathology suggested hepatic tropism with liver inflammation resembling hepatitis C. Recombinant serology for two distinct hepacivirus lineages in 97 bank voles identified seroprevalence rates of 8.3 and 12.4%, respectively. Antibodies in bank vole sera neither cross-reacted with HCV, nor the heterologous bank vole hepacivirus. Co-occurrence of RNA and antibodies was found in 3 of 57 PCR-positive bank vole sera (5.3%). Our data enable new hypotheses regarding HCV evolution and encourage efforts to develop rodent surrogate models for HCV.<br/>Le virus de l'hépatite C (VHC) est l'une des causes les plus importantes de cirrhose du foie et de carcinome hépatocellulaire. La recherche est compliquée par le manque de modèles de petits animaux accessibles. L'enquête systématique sur les virus de petits mammifères pourrait guider les efforts visant à établir de tels modèles, tout en fournissant un aperçu de la biologie évolutive virale. Nous avons rassemblé la plus grande collection d'échantillons de petits mammifères du monde entier, qualifiés pour le dépistage des virus transmissibles par le sang, y compris des sérums et des organes de 4 770 rongeurs (41 espèces) ; et des sérums de 2 939 chauves-souris (51 espèces). Trois clades d'hépacivirus rongeurs très divergents ont été détectés chez 27 (1,8 %) des 1 465 campagnols européens (Myodes glareolus) et 10 (1,9 %) des 518 souris sud-africaines à quatre bandes (Rhabdomys pumilio). Les chauves-souris ont montré des réactivités immunoblot anti-VHC mais aucune détection de virus, bien que la parenté génétique suggérée par les résultats sérologiques aurait dû permettre la détection de l'ARN à l'aide des tests de PCR largement réactifs développés pour cette étude. 210 chevaux et 858 chats et chiens ont été testés, donnant d'autres hépacivirus associés au cheval mais aucun chez les chiens ou les chats. Les virus rongeurs étaient équidistants du VHC, dépassant de loin la diversité du VHC et des hépacivirus canins/équins pris ensemble. Cinq génomes complets ont été séquencés, représentant toutes les lignées virales. Les caractéristiques saillantes du génome et les critères de distance ont soutenu la classification de tous les virus en tant qu'hépacivirus. La RT-PCR quantitative, l'hybridation in situ de l'ARN et l'histopathologie suggéraient un tropisme hépatique avec une inflammation du foie ressemblant à l'hépatite C. La sérologie recombinante pour deux lignées d'hépacivirus distinctes chez 97 campagnols blancs a identifié des taux de séroprévalence de 8,3 et 12,4 %, respectivement. Les anticorps présents dans les sérums de campagnol des bancs n'ont pas réagi de manière croisée avec le VHC, ni avec l'hépacivirus hétérologue du campagnol des bancs. La co-occurrence de l'ARN et des anticorps a été trouvée dans 3 des 57 sérums de campagnol de la banque positifs pour la PCR (5,3 %). Nos données permettent de nouvelles hypothèses concernant l'évolution du VHC et encouragent les efforts visant à développer des modèles de substitution du VHC chez les rongeurs.<br/>فيروس التهاب الكبد الوبائي سي (HCV) هو من بين الأسباب الأكثر صلة بتليف الكبد وسرطان الخلايا الكبدية. البحث معقد بسبب نقص النماذج الحيوانية الصغيرة التي يمكن الوصول إليها. يمكن أن يوجه التحقيق المنهجي في فيروسات الثدييات الصغيرة الجهود المبذولة لإنشاء مثل هذه النماذج، مع توفير نظرة ثاقبة لعلم الأحياء التطوري الفيروسي. لقد جمعنا حتى الآن أكبر مجموعة من عينات الثدييات الصغيرة من جميع أنحاء العالم، مؤهلة للفحص بحثًا عن الفيروسات المنقولة بالدم، بما في ذلك الأمصال والأعضاء من 4770 قارضًا (41 نوعًا )؛ والأمصال من 2939 خفاشًا (51 نوعًا). تم اكتشاف ثلاثة أنواع متباينة للغاية من فيروسات الكبد القوارض في 27 (1.8 ٪) من 1465 فئران بنك أوروبي (Myodes glareolus) و 10 (1.9 ٪) من 518 فئران جنوب أفريقية رباعية الخطوط (Rhabdomys pumilio). أظهرت الخفافيش نشاطات مناعية مضادة للكتلة المناعية لـ HCV ولكن لم يتم اكتشاف أي فيروس، على الرغم من أن العلاقة الجينية التي اقترحتها النتائج المصلية يجب أن تكون قد مكنت من اكتشاف الحمض النووي الريبي باستخدام فحوصات تفاعل البوليميراز المتسلسل التفاعلية على نطاق واسع التي تم تطويرها لهذه الدراسة. تم اختبار 210 حصان و 858 قطة وكلب، مما أدى إلى المزيد من فيروسات الكبد المرتبطة بالخيول ولكن لم يتم اختبارها في الكلاب أو القطط. كانت فيروسات القوارض متساوية البعد عن فيروس التهاب الكبد الوبائي، متجاوزة إلى حد بعيد تنوع فيروس التهاب الكبد الوبائي وفيروسات كبد الكلاب/الخيول مجتمعة. تم تسلسل خمسة جينومات كاملة، تمثل جميع السلالات الفيروسية. دعمت ميزات الجينوم البارزة ومعايير المسافة تصنيف جميع الفيروسات على أنها فيروسات كبدية. اقترح RT - PCR الكمي، وتهجين الحمض النووي الريبوزي في الموقع، وعلم أمراض الأنسجة الاستدارة الكبدية مع التهاب الكبد الذي يشبه التهاب الكبد C. حددت الأمصال المؤتلفة لسلالتين متميزتين من فيروسات الكبد في 97 بنكًا معدلات انتشار مصلية تبلغ 8.3 و 12.4 ٪ على التوالي. لم تتفاعل الأجسام المضادة في مصل الفرج الضفدي مع فيروس التهاب الكبد الوبائي، ولا الفيروس الكبدي الضفدي غير المتجانس. تم العثور على حدوث مشترك للحمض النووي الريبوزي والأجسام المضادة في 3 من أصل 57 مصل بنك إيجابي PCR (5.3 ٪). تتيح بياناتنا فرضيات جديدة فيما يتعلق بتطور فيروس التهاب الكبد الوبائي وتشجيع الجهود المبذولة لتطوير نماذج بديلة للقوارض لفيروس التهاب الكبد الوبائي.<br/>
SUPPLEMENTAL MATERIAL
Coming soon ....
REFERENCES (82)
CITATIONS (182)
EXTERNAL LINKS
PlumX Metrics
RECOMMENDATIONS
FAIR ASSESSMENT
Coming soon ....
JUPYTER LAB
Coming soon ....