Establishment of a Microsatellite Marker Set for Individual, Pork Brand and Product Origin Identification in Pigs

• DOI: 10.5187/jast.2009.51.3.201
• Publication Date: 2010-08-03T01:19:25Z
• Authors: Hyun-Tae Lim; Bo-Yeong Seo; Eun-Ji Jung; Chae-Kyoung Yoo; Tao Zhong; In-Cheol Cho; Du-Hak Yoon; Jung-Gyu Lee; Jin-Tae Jeon
• Keywords: Primer (cosmetics); Identification

돼지 원산지 추적 및 브랜드육 식별을 위한 MS marker set를 확립하기 위해 EU의 EID+DNA DNA Tracing 연구 project, 국제동물유전학회 Roslin 연구소 등에서 제안한 돼지의 다형성 분석에 사용되는 중 17종을 선발하여 다형성지수, F-통계량, 동일개체 출현확률 친자감별확률 등을 MSA, CERVUS, FSTAT, GENEPOP API-CALC 프로그램 연계적으로 활용하여 추정하였다. 다형성지수 추정치를 1차 선발요인으로 하고, 각 marker의 PCR 결과물의 크기 분석 비용의 경제성을 추가로 감안하여 최종 13종의 (SW936, SW951, SW787, S00090, S0026, SW122, SW857, S0005, SW72, S0155, S0225, SW24 and SW632)와 성감별을 2개의 성감별 primer로 조합된 하나의 Multiplexing 시스템을 확립하였다. 이를 이용해 사육환경을 무작위 교배집단(PI), 반형매 교배집단 그리고 전형매 교배집단으로 가정하여 출현확률을 분석한 결과 <TEX>$2.47\times10^{-18}$</TEX>, <TEX>$6.39\times10^{-13}$</TEX> <TEX>$1.08\times10^{-8}$</TEX>로 나타나 브랜드 식별 추적에 적합할 것으로 사료된다. Seventeen porcine microsatellite (MS) markers recommended by the EU ISAG institute were selected for use in individual brand identification. The programs applied calculating heterozygosity indices. By considering hetreozygosity value product size of each marker, we established a set composed 13 SW632) two sexing markers. expected probability identity among genotypes random individuals (PI), from half sibs (<TEX>$PI_{half-sibs}$</TEX>) individuals, sibs(<TEX>$PI_{sibs}$</TEX>) estimated as <TEX>$1.08\times10^{-8}$</TEX>, respectively. results indicate that can provide sufficient discriminating power both parentage identification commercial pigs produced Korea.