Estimation of Genetic Characteristic and Cumulative Power of Discrimination using the Microsatellite Markers in Korean Native Chicken

• DOI: 10.5536/kjps.2010.37.1.081
• Publication Date: 2011-05-06T01:28:19Z
• Authors: Kun-Woo Lee; Jae-Don Oh; Jin-Ah Lee; Kyu-Ho Cho; In-Sik Nam; Jun-Heon Lee; Ok-Suk Seo; Gwang-Joo Jeon; Hak-Kyo Lee; Hong-Sik Kong
• Keywords: Korean Native; Genetic distance

본 연구는 10종의 MS(microsatellite) Marker를 이용하여 한국 재래닭 품종 내 외모 특성에 의해 구분되는 3계통(적갈색: 60수, 황갈색: 46수, 흑색: 40수)과 오골계 집단(49수), 총 4계통(총 195수)에 대한 유전 특성을 분석하고, 이를 활용하여 동일성 검정을 실시할 경우 개체 식별에 신뢰도를 검정하기 위해 실시하였다. 집단 간의 유전적 유연관계를 알아보기 각 MS marker별 대립 유전자의 빈도를 산출하여 근거로 집단간의 보정을 통한 방법을 이용하는 DISPAN program을 거리에 추정 결과 R(적갈색 계통)과 L(흑색 계통)간의 거리는 0.05로 가장 가까운 것으로 나타났으며, R과 Y(황갈색 계통, 0.073), Y과 L(0.083) 역시 거리를 나타내고 있음을 확인하였다. 반면, 집단과 집단(S) 0.149(R과 S), 0.144(Y과 S) 그리고 0.158(L과 S)으로 비교적 먼 나타나 차별성을 확인할 수 있었다. marker를 대상으로 누적 식별력을 계산한 99.999%로 확인되었고 <TEX>$0.255{\times}10^{-7}$</TEX>의 짝확률 값이 추정되었다. To estimate the genetic characteristics and cumulative power of discrimination (CPD) Korean Native Chicken. We used a total 195 genomic DNAs from four breeds population (Korean Red chicken: R, Yellow Y, Black L, Ogal S). Frequencies microsatellites markers were to heterozygosities distances. The lowest distance (0.05) was observed between R L strains highest (0.158) S strains. native chicken (R, K) have each other comparatively near distance. Cumulative discriminate 99.999% by including 10 loci individual identification system. And then matching probability in that two different individuals incidentally same genotype estimated <TEX>$0.36{\times}10^{-7}$</TEX>. system employing therefore provided be applicable Korea chicken.