- Microbial Community Ecology and Physiology
- Genomics and Phylogenetic Studies
- Enzyme Production and Characterization
- Ginseng Biological Effects and Applications
- Agriculture, Soil, Plant Science
- Biofuel production and bioconversion
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- Methane Hydrates and Related Phenomena
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- Genetic diversity and population structure
- Plant Disease Resistance and Genetics
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- Pharmacological Effects of Natural Compounds
- Grouting, Rheology, and Soil Mechanics
- Plant-Microbe Interactions and Immunity
- Enzyme Catalysis and Immobilization
Mokwon University
2013-2022
A Gram-stain-negative, aerobic, non-motile, non-spore-forming, yellow and rod-shaped bacterium, designated strain CR164T, was isolated from the rhizosphere soil of a ginseng field at Geumsan in Korea. CR164T grew between 15 37 °C (optimal growth 28 °C), pH 6.0 9.0 7.0) salinities 0-1.0 % (w/v) NaCl, growing optimally absence NaCl. The results phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences indicated that represents member genus Rhodanobacter, showing highest sequence similarity to...
Three strains of a Gram-stain-negative, moderately halophilic bacterium, designated strain KHM44T, KHM29 and HHM4, were isolated from the sediment grey saltern located on Sinui island at Shinan, Korea. The isolates aerobic, non-motile rods grew 15-50 °C (optimum, 37 °C), pH 6.0-9.0 8.0) salinities 3-25 % (w/v) NaCl 10 NaCl). predominant isoprenoid quinone was menaquinone-7 (MK-7), major fatty acids iso-C15 : 0, C16 1ω7c and/or 0 2-OH, iso-C17 1ω9c anteiso-C15 0. polar lipids...
Two Gram-stain-negative, moderately halophilic bacteria, designated strains ECH52T and KHM46, were isolated from the sediment of a grey saltern located in Sinui island at Shinan, Korea. The isolates aerobic, non-motile, short rods grew 15-45 °C (optimum, 37 °C), pH 6.0-10.0 8.0) with 3-25 % (w/v) NaCl 10 NaCl). Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences indicated that KHM46 belonged to genus Aliifodinibius family Balneolaceae sequence similarities 94.3-98.6 showed highest...
A Gram-staining-positive actinobacterium, designated strain 1MR-8(T), was isolated from the rhizoplane of ginseng and its taxonomic status determined using a polyphasic approach. The isolate formed long chains spores that were straight, cylindrical smooth-surfaced. Strain 1MR-8(T) grew at 10-37 °C (optimum 28 °C), whilst no growth observed 45 °C. pH range for 4.0-11.0 6.0-8.0) NaCl 0-7% (w/v) with optimum 1% (w/v). had cell-wall peptidoglycans based on ll-diaminopimelic acid. Glucose,...
Three Gram-stain-negative, motile or non-motile, rod-shaped, facultatively aerobic strains, designated MO-4 T , NP-34 and NM-18 were isolated from oxidized rice paddy soil in Chungbuk, Republic of Korea. Colonies circular convex with entire margins, red colour on R2A after 3 days at 30 °C. The three strains grew pH 5.0–10.0 (optimum, 8.0), 15–45 °C °C) salinities 0–1.5 % (w/v) NaCl 0.4 NaCl). results phylogenetic analyses based 16S rRNA gene sequences indicated that the isolates represent...
인삼근계(근권, 근면, 근내부) 내 EPS 생성세균의 밀도를 측정한 결과, 근권토양 내에는 <TEX>$2.4{\times}10^6$</TEX> CFU/g, 근면에는 <TEX>$9.1{\times}10^6$</TEX> 그리고 근내부에는 <TEX>$2.0{\times}10^4$</TEX> CFU/g로 확인되어 다수의 생성세균이 분포하고 있음이 확인되었다. 인삼 근계로부터 생성 우수 균주 24균주를 순수분리하고 계통학적 특성을 확인한 근권(RS)으로부터 분리된 생성세균은 Arthrobacter 속 6균주, Rhizobium 1균주로 나타났다. 근면(RP)으로 부터 Rhodococcus 1균주, Pseudomonas 근내부(IR)에서 Bacillus 1균주 근권과 근면에서 세균 중 속에 속하는 균주는 가장 특징적인 세균으로 밝혀졌으며, 속은 근내부에서 생성세균으로 우수균주 sp. 1NP2 (KACC 17637)는 10 g/L 5MP1 17636)는 4.9 g/L의 다당을...
본 연구에서는 토판염전 결정지에 서식하는 세균군집의 계통학적 다양성을 분석하고 culturomics법에 기반하여 고도 호염균의 확보하고자 하였다. 내 세균밀도를 조사한 결과, 직접검경법에 의한 생균수는 평판배양법에 비해 <TEX>$10^3{\sim}10^4$</TEX> 배 이상 높은 계수치를 나타내어 배양이 곤란한 세균(viable but non-culturable bacteria, VBNC)이 다수 존재해 있음으로 판단되었다. 결정지 세균군집 다양성 해석을 위해 배양비의존적 방법인 pyrosequencing 분자기법을 이용하였다. 경우 1,778 OTUs, 지수 6.16로 나타났으며, 18문46강85목140과 243속으로 확인되었다. Archaea군집은 643 4.95로 3문6강7목7과 38속이 분포해 있음이 호염균 생육에 적합한 배양배지 및 배양조건을 고려한 총 59가지의 다양한 배양 방법을 이용하여 137균주를 순수 분리하였다. 분리된 고도호염균의 16S rRNA 유전자...
A novel moderately halophilic bacterium, designated strain KHM2T, was isolated from the sediment of a grey solar saltern located on Sinui Island, Shinan, Republic Korea. Cells were rod-shaped, endospore-forming, Gram-stain-positive, motile and facultative anaerobic. Strain KHM2T performed anaerobic respiration using nitrates did not produce glucose acids, indicating absence fermentation. grew at 10-45 °C (optimum, 37 °C), pH 6.0-10.0 8.0) with 1.0-20.0 % (w/v) NaCl 10.0%). Based 16S rRNA...
소금생산을 위해 25% 이상의 함수를 저장해 놓는 염전의 해주로부터 호염성 세균 4균주를 분리하고 높은 염분농도에서도 <TEX>${\beta}$</TEX>-glucosidase를 생성하는 HJS1과 HJS6 균주를 선발하였다. 이들 <TEX>${\beta}$</TEX>-glucosidase 생성세균은 NaCl 1-10%에서 70-79U/mg의 최적 활성을 나타내었고, 3%에서 최대 나타내었으며 0-20% 농도에서 효소 활성대비 75%이상의 효소활성을 유지하는 내염성 것으로 확인되었다. 생성 균주의 16S rRNA 유전자 염기서열을 검토한 결과, Roseivivax roseus <TEX>$BH87090^T$</TEX> (FJ897782)와 99.8%의 상동성을 나타내었고 상기 균주들의 염기서열은 NCBI GenBank에 각각 AB971835와 AB971836로 등록하였다. 계통학적으로 근연종인 <TEX>$BH87090^T$</TEX>와의 DNA-DNA 비교 90.1-90.3%를...
인삼 근계(근권, 근면, 근내부)로부터 ginsenoside Rb1 전환효소인 <TEX>${\beta}$</TEX>-glucosidase 생산 균주(BGB)를 분리하였다. 근계부터 분리된 BGB 28균주의 계통학적 특성을 확인한 결과, 근권에서 Stenotrophomonas 속(3균주), Pseudoxanthomonas 속(1균주), Bacillus 속(1균주)로 확인되었다. 근면로부터 BGB는 속(16균주), Streptomyces Microbacterium 속(1균주)이며, 근내부는 Lysobacter 속(2균주)를 포함하는 다양한 계통군이 확인 되었다. 특히 근계로부터 균주의 90%가 계통군에 속하는 특징을 나타내었다. 근권으로부터 4KR4 균주는 108.17 unit의 활성을 나타내었으며, Rb1을 Rd, Rg3 그리고 minor Rh2로 전환되었다. rhizophila e-<TEX>$p10^T$</TEX> (AJ293463)와 99.65%의 높은 상동성을 본 연구에서...